Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GREB1Q4ZG55 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GREB1Q4ZG55 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GREB1Q4ZG55 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GREB1Q4ZG55 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GREB1Q4ZG55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GREB1Q4ZG55 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GREB1Q4ZG55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GREB1Q4ZG55 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GREB1Q4ZG55 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GREB1Q4ZG55 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GREB1Q4ZG55 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GREB1Q4ZG55 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GREB1Q4ZG55 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GREB1Q4ZG55 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GREB1Q4ZG55 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GREB1Q4ZG55 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GREB1Q4ZG55 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GREB1Q4ZG55 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GREB1Q4ZG55 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GREB1Q4ZG55 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GREB1Q4ZG55 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GREB1Q4ZG55 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GREB1Q4ZG55 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GREB1Q4ZG55 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GREB1Q4ZG55 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GREB1Q4ZG55 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GREB1Q4ZG55 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1Q4ZG55 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1Q4ZG55 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1Q4ZG55 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1Q4ZG55 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1Q4ZG55 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1Q4ZG55 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GREB1Q4ZG55 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GREB1Q4ZG55 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1Q4ZG55 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GREB1Q4ZG55 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GREB1Q4ZG55 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GREB1Q4ZG55 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GREB1Q4ZG55 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GREB1Q4ZG55 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GREB1Q4ZG55 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GREB1Q4ZG55 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GREB1Q4ZG55 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GREB1Q4ZG55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GREB1Q4ZG55 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GREB1Q4ZG55 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GREB1Q4ZG55 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GREB1Q4ZG55 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GREB1Q4ZG55 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GREB1Q4ZG55 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GREB1Q4ZG55 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GREB1Q4ZG55 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GREB1Q4ZG55 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GREB1Q4ZG55 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GREB1Q4ZG55 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GREB1Q4ZG55 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GREB1Q4ZG55 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GREB1Q4ZG55 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GREB1Q4ZG55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GREB1Q4ZG55 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms