Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TBRG1Q3YBR2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TBRG1Q3YBR2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TBRG1Q3YBR2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBRG1Q3YBR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TBRG1Q3YBR2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TBRG1Q3YBR2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBRG1Q3YBR2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBRG1Q3YBR2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TBRG1Q3YBR2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBRG1Q3YBR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TBRG1Q3YBR2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TBRG1Q3YBR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TBRG1Q3YBR2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TBRG1Q3YBR2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TBRG1Q3YBR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TBRG1Q3YBR2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TBRG1Q3YBR2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBRG1Q3YBR2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBRG1Q3YBR2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBRG1Q3YBR2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBRG1Q3YBR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBRG1Q3YBR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBRG1Q3YBR2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBRG1Q3YBR2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBRG1Q3YBR2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBRG1Q3YBR2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBRG1Q3YBR2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBRG1Q3YBR2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBRG1Q3YBR2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TBRG1Q3YBR2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBRG1Q3YBR2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBRG1Q3YBR2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBRG1Q3YBR2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBRG1Q3YBR2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TBRG1Q3YBR2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBRG1Q3YBR2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms