Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP13-4Q3LI77 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP13-4Q3LI77 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP13-4Q3LI77 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KRTAP13-4Q3LI77 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-4Q3LI77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP13-4Q3LI77 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms