Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTAP21-3Q3LHN1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRTAP21-3Q3LHN1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRTAP21-3Q3LHN1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP21-3Q3LHN1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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