Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP5B1Q2VPB7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP5B1Q2VPB7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP5B1Q2VPB7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP5B1Q2VPB7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP5B1Q2VPB7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP5B1Q2VPB7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
AP5B1Q2VPB7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP5B1Q2VPB7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP5B1Q2VPB7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP5B1Q2VPB7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP5B1Q2VPB7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP5B1Q2VPB7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP5B1Q2VPB7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP5B1Q2VPB7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP5B1Q2VPB7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP5B1Q2VPB7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP5B1Q2VPB7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP5B1Q2VPB7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP5B1Q2VPB7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP5B1Q2VPB7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP5B1Q2VPB7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP5B1Q2VPB7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5B1Q2VPB7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5B1Q2VPB7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP5B1Q2VPB7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5B1Q2VPB7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP5B1Q2VPB7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP5B1Q2VPB7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP5B1Q2VPB7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP5B1Q2VPB7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP5B1Q2VPB7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP5B1Q2VPB7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP5B1Q2VPB7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP5B1Q2VPB7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP5B1Q2VPB7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP5B1Q2VPB7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP5B1Q2VPB7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP5B1Q2VPB7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP5B1Q2VPB7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms