Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6LQ2NKX8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6LQ2NKX8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6LQ2NKX8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6LQ2NKX8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6LQ2NKX8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6LQ2NKX8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6LQ2NKX8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6LQ2NKX8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6LQ2NKX8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERCC6LQ2NKX8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6LQ2NKX8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6LQ2NKX8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERCC6LQ2NKX8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERCC6LQ2NKX8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERCC6LQ2NKX8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ERCC6LQ2NKX8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERCC6LQ2NKX8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERCC6LQ2NKX8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ERCC6LQ2NKX8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERCC6LQ2NKX8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERCC6LQ2NKX8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6LQ2NKX8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERCC6LQ2NKX8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERCC6LQ2NKX8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6LQ2NKX8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6LQ2NKX8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6LQ2NKX8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6LQ2NKX8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERCC6LQ2NKX8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
ERCC6LQ2NKX8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERCC6LQ2NKX8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERCC6LQ2NKX8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERCC6LQ2NKX8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERCC6LQ2NKX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6LQ2NKX8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERCC6LQ2NKX8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6LQ2NKX8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERCC6LQ2NKX8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERCC6LQ2NKX8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERCC6LQ2NKX8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERCC6LQ2NKX8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6LQ2NKX8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6LQ2NKX8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6LQ2NKX8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6LQ2NKX8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6LQ2NKX8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6LQ2NKX8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6LQ2NKX8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERCC6LQ2NKX8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6LQ2NKX8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6LQ2NKX8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6LQ2NKX8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERCC6LQ2NKX8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERCC6LQ2NKX8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6LQ2NKX8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERCC6LQ2NKX8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC6LQ2NKX8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERCC6LQ2NKX8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms