Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPO4Q2I0M5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPO4Q2I0M5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPO4Q2I0M5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RSPO4Q2I0M5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPO4Q2I0M5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPO4Q2I0M5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPO4Q2I0M5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RSPO4Q2I0M5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RSPO4Q2I0M5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RSPO4Q2I0M5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RSPO4Q2I0M5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RSPO4Q2I0M5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RSPO4Q2I0M5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RSPO4Q2I0M5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPO4Q2I0M5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RSPO4Q2I0M5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RSPO4Q2I0M5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RSPO4Q2I0M5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPO4Q2I0M5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPO4Q2I0M5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPO4Q2I0M5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPO4Q2I0M5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RSPO4Q2I0M5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPO4Q2I0M5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPO4Q2I0M5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPO4Q2I0M5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPO4Q2I0M5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPO4Q2I0M5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPO4Q2I0M5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPO4Q2I0M5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPO4Q2I0M5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPO4Q2I0M5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPO4Q2I0M5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPO4Q2I0M5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPO4Q2I0M5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPO4Q2I0M5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPO4Q2I0M5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RSPO4Q2I0M5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RSPO4Q2I0M5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RSPO4Q2I0M5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RSPO4Q2I0M5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RSPO4Q2I0M5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RSPO4Q2I0M5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPO4Q2I0M5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPO4Q2I0M5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPO4Q2I0M5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPO4Q2I0M5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPO4Q2I0M5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPO4Q2I0M5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPO4Q2I0M5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RSPO4Q2I0M5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RSPO4Q2I0M5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPO4Q2I0M5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPO4Q2I0M5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPO4Q2I0M5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPO4Q2I0M5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPO4Q2I0M5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPO4Q2I0M5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPO4Q2I0M5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPO4Q2I0M5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPO4Q2I0M5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RSPO4Q2I0M5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPO4Q2I0M5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPO4Q2I0M5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPO4Q2I0M5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPO4Q2I0M5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RSPO4Q2I0M5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPO4Q2I0M5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPO4Q2I0M5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPO4Q2I0M5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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