Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRNQ16849 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRNQ16849 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRNQ16849 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRNQ16849 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRNQ16849 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRNQ16849 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRNQ16849 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRNQ16849 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRNQ16849 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRNQ16849 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRNQ16849 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRNQ16849 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRNQ16849 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRNQ16849 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRNQ16849 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRNQ16849 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRNQ16849 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRNQ16849 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRNQ16849 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRNQ16849 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRNQ16849 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRNQ16849 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRNQ16849 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRNQ16849 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRNQ16849 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRNQ16849 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRNQ16849 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRNQ16849 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRNQ16849 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRNQ16849 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRNQ16849 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRNQ16849 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRNQ16849 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRNQ16849 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRNQ16849 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRNQ16849 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRNQ16849 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRNQ16849 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRNQ16849 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRNQ16849 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRNQ16849 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRNQ16849 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRNQ16849 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRNQ16849 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRNQ16849 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRNQ16849 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRNQ16849 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRNQ16849 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRNQ16849 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRNQ16849 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRNQ16849 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRNQ16849 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRNQ16849 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRNQ16849 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRNQ16849 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRNQ16849 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRNQ16849 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRNQ16849 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRNQ16849 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRNQ16849 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRNQ16849 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRNQ16849 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRNQ16849 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRNQ16849 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRNQ16849 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRNQ16849 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRNQ16849 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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