Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
LAMA3Q16787 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMA3Q16787 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMA3Q16787 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMA3Q16787 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMA3Q16787 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LAMA3Q16787 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMA3Q16787 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMA3Q16787 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LAMA3Q16787 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMA3Q16787 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMA3Q16787 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMA3Q16787 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMA3Q16787 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMA3Q16787 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMA3Q16787 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMA3Q16787 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMA3Q16787 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMA3Q16787 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAMA3Q16787 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMA3Q16787 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMA3Q16787 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMA3Q16787 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMA3Q16787 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMA3Q16787 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LAMA3Q16787 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMA3Q16787 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMA3Q16787 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMA3Q16787 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMA3Q16787 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMA3Q16787 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMA3Q16787 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LAMA3Q16787 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMA3Q16787 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMA3Q16787 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMA3Q16787 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LAMA3Q16787 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LAMA3Q16787 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMA3Q16787 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMA3Q16787 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LAMA3Q16787 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LAMA3Q16787 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LAMA3Q16787 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LAMA3Q16787 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LAMA3Q16787 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LAMA3Q16787 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LAMA3Q16787 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LAMA3Q16787 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LAMA3Q16787 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LAMA3Q16787 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LAMA3Q16787 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LAMA3Q16787 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LAMA3Q16787 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
LAMA3Q16787 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LAMA3Q16787 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
LAMA3Q16787 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LAMA3Q16787 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
LAMA3Q16787 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LAMA3Q16787 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LAMA3Q16787 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LAMA3Q16787 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
LAMA3Q16787 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LAMA3Q16787 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LAMA3Q16787 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMA3Q16787 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMA3Q16787 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMA3Q16787 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMA3Q16787 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMA3Q16787 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMA3Q16787 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMA3Q16787 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMA3Q16787 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMA3Q16787 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LAMA3Q16787 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMA3Q16787 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LAMA3Q16787 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LAMA3Q16787 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LAMA3Q16787 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
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