Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF239Q16600 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF239Q16600 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF239Q16600 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF239Q16600 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF239Q16600 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF239Q16600 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF239Q16600 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF239Q16600 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF239Q16600 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF239Q16600 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF239Q16600 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF239Q16600 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF239Q16600 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF239Q16600 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF239Q16600 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF239Q16600 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF239Q16600 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF239Q16600 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF239Q16600 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF239Q16600 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF239Q16600 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF239Q16600 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF239Q16600 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF239Q16600 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF239Q16600 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF239Q16600 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF239Q16600 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF239Q16600 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF239Q16600 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF239Q16600 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF239Q16600 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF239Q16600 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF239Q16600 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF239Q16600 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF239Q16600 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF239Q16600 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF239Q16600 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF239Q16600 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF239Q16600 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF239Q16600 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF239Q16600 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF239Q16600 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF239Q16600 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF239Q16600 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF239Q16600 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF239Q16600 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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