Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGA3Q16281 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGA3Q16281 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNGA3Q16281 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGA3Q16281 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGA3Q16281 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGA3Q16281 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGA3Q16281 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNGA3Q16281 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGA3Q16281 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNGA3Q16281 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CNGA3Q16281 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNGA3Q16281 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNGA3Q16281 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNGA3Q16281 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNGA3Q16281 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGA3Q16281 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA3Q16281 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGA3Q16281 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA3Q16281 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA3Q16281 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA3Q16281 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA3Q16281 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA3Q16281 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGA3Q16281 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGA3Q16281 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA3Q16281 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA3Q16281 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA3Q16281 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGA3Q16281 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGA3Q16281 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA3Q16281 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGA3Q16281 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA3Q16281 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA3Q16281 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA3Q16281 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGA3Q16281 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA3Q16281 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA3Q16281 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNGA3Q16281 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA3Q16281 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA3Q16281 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGA3Q16281 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA3Q16281 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA3Q16281 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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