Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAMP3Q15836 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAMP3Q15836 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP3Q15836 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP3Q15836 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP3Q15836 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAMP3Q15836 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAMP3Q15836 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAMP3Q15836 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VAMP3Q15836 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP3Q15836 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VAMP3Q15836 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VAMP3Q15836 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VAMP3Q15836 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP3Q15836 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP3Q15836 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAMP3Q15836 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAMP3Q15836 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAMP3Q15836 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAMP3Q15836 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAMP3Q15836 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP3Q15836 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP3Q15836 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP3Q15836 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP3Q15836 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP3Q15836 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP3Q15836 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP3Q15836 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP3Q15836 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP3Q15836 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP3Q15836 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP3Q15836 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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