Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
MED1Q15648 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
MED1Q15648 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
MED1Q15648 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
MED1Q15648 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
MED1Q15648 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
MED1Q15648 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
MED1Q15648 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
MED1Q15648 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
MED1Q15648 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
MED1Q15648 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
MED1Q15648 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
MED1Q15648 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
MED1Q15648 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
MED1Q15648 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
MED1Q15648 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
MED1Q15648 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
MED1Q15648 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
MED1Q15648 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
MED1Q15648 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
MED1Q15648 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
MED1Q15648 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
MED1Q15648 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
MED1Q15648 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
MED1Q15648 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
MED1Q15648 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
MED1Q15648 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
MED1Q15648 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
MED1Q15648 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
MED1Q15648 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
MED1Q15648 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
MED1Q15648 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
MED1Q15648 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
MED1Q15648 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
MED1Q15648 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
MED1Q15648 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
MED1Q15648 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
MED1Q15648 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
MED1Q15648 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
MED1Q15648 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
MED1Q15648 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
MED1Q15648 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
MED1Q15648 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
MED1Q15648 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
MED1Q15648 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
MED1Q15648 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
MED1Q15648 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
MED1Q15648 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
MED1Q15648 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
MED1Q15648 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
MED1Q15648 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
MED1Q15648 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
MED1Q15648 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
MED1Q15648 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MED1Q15648 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MED1Q15648 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
MED1Q15648 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
MED1Q15648 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
MED1Q15648 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
MED1Q15648 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MED1Q15648 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
MED1Q15648 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MED1Q15648 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MED1Q15648 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
MED1Q15648 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
MED1Q15648 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
MED1Q15648 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
MED1Q15648 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
MED1Q15648 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
MED1Q15648 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
MED1Q15648 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
MED1Q15648 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
MED1Q15648 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MED1Q15648 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MED1Q15648 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
MED1Q15648 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
MED1Q15648 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
MED1Q15648 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
MED1Q15648 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MED1Q15648 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
MED1Q15648 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
MED1Q15648 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
MED1Q15648 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
MED1Q15648 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
MED1Q15648 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MED1Q15648 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MED1Q15648 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
MED1Q15648 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
MED1Q15648 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
MED1Q15648 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
MED1Q15648 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
MED1Q15648 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
MED1Q15648 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
MED1Q15648 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
MED1Q15648 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
MED1Q15648 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
MED1Q15648 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
MED1Q15648 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
MED1Q15648 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
MED1Q15648 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms