Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF1Q15637 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SF1Q15637 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF1Q15637 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF1Q15637 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF1Q15637 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF1Q15637 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SF1Q15637 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF1Q15637 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF1Q15637 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF1Q15637 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SF1Q15637 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF1Q15637 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF1Q15637 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SF1Q15637 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SF1Q15637 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SF1Q15637 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF1Q15637 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SF1Q15637 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SF1Q15637 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SF1Q15637 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF1Q15637 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF1Q15637 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF1Q15637 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SF1Q15637 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF1Q15637 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF1Q15637 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SF1Q15637 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF1Q15637 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF1Q15637 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF1Q15637 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF1Q15637 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF1Q15637 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF1Q15637 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF1Q15637 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF1Q15637 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF1Q15637 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF1Q15637 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF1Q15637 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF1Q15637 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SF1Q15637 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF1Q15637 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SF1Q15637 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SF1Q15637 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SF1Q15637 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SF1Q15637 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SF1Q15637 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF1Q15637 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SF1Q15637 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SF1Q15637 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SF1Q15637 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF1Q15637 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SF1Q15637 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SF1Q15637 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF1Q15637 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SF1Q15637 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF1Q15637 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF1Q15637 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF1Q15637 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF1Q15637 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF1Q15637 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF1Q15637 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF1Q15637 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF1Q15637 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF1Q15637 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF1Q15637 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF1Q15637 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF1Q15637 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF1Q15637 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF1Q15637 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF1Q15637 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF1Q15637 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF1Q15637 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF1Q15637 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF1Q15637 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF1Q15637 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF1Q15637 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF1Q15637 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF1Q15637 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF1Q15637 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF1Q15637 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF1Q15637 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF1Q15637 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF1Q15637 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF1Q15637 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF1Q15637 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF1Q15637 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF1Q15637 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF1Q15637 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF1Q15637 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF1Q15637 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF1Q15637 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF1Q15637 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF1Q15637 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF1Q15637 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SF1Q15637 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF1Q15637 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SF1Q15637 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SF1Q15637 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF1Q15637 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms