Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RYR3Q15413 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RYR3Q15413 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RYR3Q15413 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RYR3Q15413 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RYR3Q15413 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RYR3Q15413 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RYR3Q15413 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RYR3Q15413 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RYR3Q15413 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RYR3Q15413 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RYR3Q15413 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RYR3Q15413 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RYR3Q15413 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RYR3Q15413 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYR3Q15413 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RYR3Q15413 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RYR3Q15413 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RYR3Q15413 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RYR3Q15413 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RYR3Q15413 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RYR3Q15413 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYR3Q15413 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYR3Q15413 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYR3Q15413 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RYR3Q15413 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RYR3Q15413 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RYR3Q15413 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RYR3Q15413 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYR3Q15413 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RYR3Q15413 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RYR3Q15413 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RYR3Q15413 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RYR3Q15413 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RYR3Q15413 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RYR3Q15413 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RYR3Q15413 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RYR3Q15413 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RYR3Q15413 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYR3Q15413 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RYR3Q15413 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RYR3Q15413 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RYR3Q15413 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYR3Q15413 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYR3Q15413 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RYR3Q15413 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RYR3Q15413 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RYR3Q15413 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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