Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 37.28□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 117.3
PCBP2Q15366 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 116.4
PCBP2Q15366 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.52e-9■■■■■ 116.4
PCBP2Q15366 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 515.27■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 116.4
PCBP2Q15366 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.986e-8■■■■■ 115.8
PCBP2Q15366 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 56.95□□□□□ -1.31e-19■■■■■ 114.8
PCBP2Q15366 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 531.7■■■□□ 2.662e-8■■■■■ 114
PCBP2Q15366 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.182e-8■■■■■ 114
PCBP2Q15366 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.072e-8■■■■■ 114
PCBP2Q15366 BCAM-204ENST00000588714 723 ntTSL 213.43□□□□□ -0.261e-182■■■■■ 113.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 310.41□□□□□ -0.743e-13■■■■■ 113.6
PCBP2Q15366 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -03e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 SSH2-205ENST00000577483 1630 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 SSH2-207ENST00000578411 633 ntTSL 211.3□□□□□ -0.63e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 SSH2-208ENST00000579040 965 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.453e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-9■■■■■ 113.5
PCBP2Q15366 CDK6-204ENST00000473078 386 ntTSL 22.05□□□□□ -2.081e-21■■■■■ 113.1
PCBP2Q15366 PRH1-203ENST00000538332 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.04□□□□□ -1.762e-26■■■■■ 112.5
PCBP2Q15366 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 111.9
PCBP2Q15366 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 111.9
PCBP2Q15366 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 515.57■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 111.9
PCBP2Q15366 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 37.49□□□□□ -1.216e-8■■■■■ 111.3
PCBP2Q15366 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.693e-11■■■■■ 110.5
PCBP2Q15366 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 110.5
PCBP2Q15366 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-11■■■■■ 110.5
PCBP2Q15366 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 514.35□□□□□ -0.113e-13■■■■■ 109.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-13■■■■■ 109.9
PCBP2Q15366 WNK2-208ENST00000453718 1937 ntTSL 516.25■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 108.2
PCBP2Q15366 WNK2-214ENST00000474009 561 ntTSL 316.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 108.2
PCBP2Q15366 WNK2-216ENST00000479696 532 ntTSL 37.2□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 108.2
PCBP2Q15366 PARN-212ENST00000564882 452 ntTSL 37.76□□□□□ -1.179e-10■■■■■ 108
PCBP2Q15366 UBE2D2-204ENST00000505007 1170 ntTSL 317.87■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 107.8
PCBP2Q15366 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 107.8
PCBP2Q15366 UBE2D2-206ENST00000510470 256 ntTSL 27.55□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 107.8
PCBP2Q15366 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 12e-33■■■■■ 107.7
PCBP2Q15366 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.912e-33■■■■■ 107.7
PCBP2Q15366 GABPB1-212ENST00000615671 6266 nt18.57■□□□□ 0.565e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.055e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.355e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-208ENST00000558970 730 ntTSL 511.92□□□□□ -0.55e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.045e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.465e-39■■■■■ 107
PCBP2Q15366 UBE2D2-203ENST00000398734 901 ntTSL 56.97□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 107
PCBP2Q15366 YWHAE-206ENST00000496706 732 ntTSL 37.24□□□□□ -1.253e-41■■■■■ 106.8
PCBP2Q15366 HIPK3-205ENST00000531504 591 ntTSL 218.37■□□□□ 0.534e-27■■■■■ 105
PCBP2Q15366 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-27■■■■■ 105
PCBP2Q15366 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.154e-27■■■■■ 105
PCBP2Q15366 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-27■■■■■ 105
PCBP2Q15366 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.694e-27■■■■■ 105
PCBP2Q15366 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.152e-30■■■■■ 104.7
PCBP2Q15366 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.172e-30■■■■■ 104.7
PCBP2Q15366 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 56.69□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 104.5
PCBP2Q15366 DZIP1-206ENST00000466569 1783 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.771e-19■■■■■ 104.3
PCBP2Q15366 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.081e-19■■■■■ 104.3
PCBP2Q15366 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-19■■■■■ 104.3
PCBP2Q15366 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-19■■■■■ 104.3
PCBP2Q15366 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-19■■■■■ 104.3
PCBP2Q15366 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.161e-30■■■■■ 104.1
PCBP2Q15366 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.82e-8■■■■■ 103.6
PCBP2Q15366 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 103.6
PCBP2Q15366 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.396e-9■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.596e-9■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.636e-9■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.759e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 219.75■□□□□ 0.759e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.649e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.599e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.239e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.149e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-211ENST00000623253 573 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.049e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 CD99-201ENST00000381177 756 ntTSL 29.55□□□□□ -0.889e-11■■■■■ 103.5
PCBP2Q15366 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 216.08■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 103.4
PCBP2Q15366 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 103.4
PCBP2Q15366 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 103.4
PCBP2Q15366 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 103.4
PCBP2Q15366 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 211.91□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-206ENST00000447406 1146 ntTSL 517.22■□□□□ 0.352e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-210ENST00000492703 726 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-205ENST00000438549 631 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.242e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-208ENST00000473615 2075 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-209ENST00000480153 2447 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.582e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 DSN1-202ENST00000373740 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.92e-16■■■■■ 102.9
PCBP2Q15366 SLC7A5-202ENST00000563489 780 ntTSL 214.42□□□□□ -0.11e-18■■■■■ 102.3
PCBP2Q15366 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 318.61■□□□□ 0.578e-12■■■■■ 102.2
PCBP2Q15366 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 515.38■□□□□ 0.058e-12■■■■■ 102.2
PCBP2Q15366 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 213.01□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 102.1
PCBP2Q15366 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.077e-20■■■■■ 101.4
PCBP2Q15366 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.967e-20■■■■■ 101.4
PCBP2Q15366 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.817e-20■■■■■ 101.4
PCBP2Q15366 YJEFN3-202ENST00000458210 2785 ntTSL 214.9□□□□□ -0.027e-20■■■■■ 101.4
PCBP2Q15366 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-26■■■■■ 100.3
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 92.3 ms