Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCN1Q15293 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCN1Q15293 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCN1Q15293 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCN1Q15293 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCN1Q15293 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCN1Q15293 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCN1Q15293 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCN1Q15293 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCN1Q15293 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCN1Q15293 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCN1Q15293 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCN1Q15293 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCN1Q15293 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCN1Q15293 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCN1Q15293 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCN1Q15293 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RCN1Q15293 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCN1Q15293 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCN1Q15293 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCN1Q15293 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCN1Q15293 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCN1Q15293 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCN1Q15293 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCN1Q15293 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCN1Q15293 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCN1Q15293 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RCN1Q15293 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RCN1Q15293 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCN1Q15293 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCN1Q15293 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCN1Q15293 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCN1Q15293 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCN1Q15293 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCN1Q15293 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCN1Q15293 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCN1Q15293 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCN1Q15293 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCN1Q15293 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RCN1Q15293 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCN1Q15293 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCN1Q15293 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCN1Q15293 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RCN1Q15293 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCN1Q15293 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCN1Q15293 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCN1Q15293 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCN1Q15293 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCN1Q15293 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms