Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAB3GAP1Q15042 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAB3GAP1Q15042 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAB3GAP1Q15042 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAB3GAP1Q15042 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAB3GAP1Q15042 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAB3GAP1Q15042 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAB3GAP1Q15042 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB3GAP1Q15042 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
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