Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHD4Q14839 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHD4Q14839 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CHD4Q14839 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CHD4Q14839 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CHD4Q14839 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHD4Q14839 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CHD4Q14839 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CHD4Q14839 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHD4Q14839 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHD4Q14839 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHD4Q14839 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHD4Q14839 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHD4Q14839 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHD4Q14839 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHD4Q14839 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHD4Q14839 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHD4Q14839 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHD4Q14839 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHD4Q14839 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CHD4Q14839 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CHD4Q14839 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CHD4Q14839 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CHD4Q14839 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHD4Q14839 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CHD4Q14839 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHD4Q14839 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CHD4Q14839 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CHD4Q14839 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CHD4Q14839 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CHD4Q14839 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD4Q14839 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD4Q14839 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CHD4Q14839 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHD4Q14839 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD4Q14839 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD4Q14839 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHD4Q14839 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHD4Q14839 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHD4Q14839 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHD4Q14839 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHD4Q14839 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHD4Q14839 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHD4Q14839 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHD4Q14839 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHD4Q14839 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHD4Q14839 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHD4Q14839 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHD4Q14839 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHD4Q14839 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHD4Q14839 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHD4Q14839 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHD4Q14839 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CHD4Q14839 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHD4Q14839 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHD4Q14839 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CHD4Q14839 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CHD4Q14839 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CHD4Q14839 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CHD4Q14839 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CHD4Q14839 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CHD4Q14839 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHD4Q14839 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CHD4Q14839 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CHD4Q14839 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHD4Q14839 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CHD4Q14839 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHD4Q14839 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CHD4Q14839 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD4Q14839 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHD4Q14839 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD4Q14839 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD4Q14839 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD4Q14839 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD4Q14839 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD4Q14839 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CHD4Q14839 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CHD4Q14839 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CHD4Q14839 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHD4Q14839 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CHD4Q14839 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHD4Q14839 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CHD4Q14839 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CHD4Q14839 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CHD4Q14839 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHD4Q14839 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CHD4Q14839 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CHD4Q14839 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CHD4Q14839 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CHD4Q14839 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CHD4Q14839 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
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