Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CBX2Q14781 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CBX2Q14781 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CBX2Q14781 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CBX2Q14781 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CBX2Q14781 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CBX2Q14781 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CBX2Q14781 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CBX2Q14781 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CBX2Q14781 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CBX2Q14781 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CBX2Q14781 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CBX2Q14781 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CBX2Q14781 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CBX2Q14781 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CBX2Q14781 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CBX2Q14781 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CBX2Q14781 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CBX2Q14781 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CBX2Q14781 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CBX2Q14781 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CBX2Q14781 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CBX2Q14781 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CBX2Q14781 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CBX2Q14781 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CBX2Q14781 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CBX2Q14781 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CBX2Q14781 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CBX2Q14781 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CBX2Q14781 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CBX2Q14781 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CBX2Q14781 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CBX2Q14781 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CBX2Q14781 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CBX2Q14781 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CBX2Q14781 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CBX2Q14781 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CBX2Q14781 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CBX2Q14781 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CBX2Q14781 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CBX2Q14781 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CBX2Q14781 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CBX2Q14781 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CBX2Q14781 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CBX2Q14781 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CBX2Q14781 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CBX2Q14781 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CBX2Q14781 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CBX2Q14781 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CBX2Q14781 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CBX2Q14781 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CBX2Q14781 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms