Protein–RNA interactions for Protein: Q14679

TTLL4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, humanhuman

Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4Q14679 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TTLL4Q14679 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TTLL4Q14679 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TTLL4Q14679 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TTLL4Q14679 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TTLL4Q14679 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TTLL4Q14679 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TTLL4Q14679 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TTLL4Q14679 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TTLL4Q14679 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TTLL4Q14679 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TTLL4Q14679 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TTLL4Q14679 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TTLL4Q14679 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TTLL4Q14679 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TTLL4Q14679 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TTLL4Q14679 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TTLL4Q14679 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TTLL4Q14679 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TTLL4Q14679 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TTLL4Q14679 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TTLL4Q14679 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TTLL4Q14679 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TTLL4Q14679 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TTLL4Q14679 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TTLL4Q14679 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TTLL4Q14679 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TTLL4Q14679 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TTLL4Q14679 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TTLL4Q14679 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TTLL4Q14679 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TTLL4Q14679 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TTLL4Q14679 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TTLL4Q14679 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TTLL4Q14679 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TTLL4Q14679 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TTLL4Q14679 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TTLL4Q14679 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TTLL4Q14679 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TTLL4Q14679 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TTLL4Q14679 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TTLL4Q14679 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TTLL4Q14679 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TTLL4Q14679 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TTLL4Q14679 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TTLL4Q14679 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TTLL4Q14679 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TTLL4Q14679 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TTLL4Q14679 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TTLL4Q14679 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TTLL4Q14679 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TTLL4Q14679 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TTLL4Q14679 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TTLL4Q14679 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TTLL4Q14679 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TTLL4Q14679 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TTLL4Q14679 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL4Q14679 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL4Q14679 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TTLL4Q14679 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TTLL4Q14679 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL4Q14679 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL4Q14679 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TTLL4Q14679 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTLL4Q14679 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TTLL4Q14679 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TTLL4Q14679 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TTLL4Q14679 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL4Q14679 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTLL4Q14679 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL4Q14679 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL4Q14679 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTLL4Q14679 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL4Q14679 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL4Q14679 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL4Q14679 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TTLL4Q14679 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TTLL4Q14679 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TTLL4Q14679 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TTLL4Q14679 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTLL4Q14679 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
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