Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SCARF1Q14162 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SCARF1Q14162 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SCARF1Q14162 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCARF1Q14162 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SCARF1Q14162 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCARF1Q14162 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SCARF1Q14162 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCARF1Q14162 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCARF1Q14162 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCARF1Q14162 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCARF1Q14162 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCARF1Q14162 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCARF1Q14162 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SCARF1Q14162 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SCARF1Q14162 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCARF1Q14162 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCARF1Q14162 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCARF1Q14162 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCARF1Q14162 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCARF1Q14162 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCARF1Q14162 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCARF1Q14162 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCARF1Q14162 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCARF1Q14162 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SCARF1Q14162 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCARF1Q14162 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCARF1Q14162 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCARF1Q14162 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCARF1Q14162 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCARF1Q14162 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCARF1Q14162 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SCARF1Q14162 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCARF1Q14162 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCARF1Q14162 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCARF1Q14162 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCARF1Q14162 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCARF1Q14162 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCARF1Q14162 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCARF1Q14162 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCARF1Q14162 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SCARF1Q14162 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SCARF1Q14162 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SCARF1Q14162 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SCARF1Q14162 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCARF1Q14162 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SCARF1Q14162 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCARF1Q14162 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCARF1Q14162 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCARF1Q14162 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SCARF1Q14162 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCARF1Q14162 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCARF1Q14162 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SCARF1Q14162 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SCARF1Q14162 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SCARF1Q14162 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SCARF1Q14162 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCARF1Q14162 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SCARF1Q14162 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCARF1Q14162 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SCARF1Q14162 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCARF1Q14162 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCARF1Q14162 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCARF1Q14162 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
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