Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC2Q13868 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC2Q13868 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC2Q13868 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC2Q13868 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC2Q13868 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC2Q13868 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC2Q13868 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC2Q13868 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC2Q13868 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC2Q13868 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC2Q13868 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC2Q13868 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC2Q13868 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC2Q13868 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC2Q13868 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC2Q13868 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC2Q13868 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC2Q13868 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC2Q13868 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC2Q13868 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC2Q13868 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC2Q13868 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC2Q13868 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC2Q13868 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC2Q13868 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC2Q13868 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC2Q13868 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC2Q13868 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC2Q13868 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC2Q13868 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC2Q13868 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC2Q13868 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC2Q13868 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC2Q13868 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC2Q13868 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EXOSC2Q13868 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC2Q13868 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC2Q13868 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC2Q13868 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC2Q13868 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC2Q13868 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EXOSC2Q13868 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EXOSC2Q13868 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EXOSC2Q13868 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC2Q13868 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC2Q13868 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC2Q13868 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC2Q13868 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXOSC2Q13868 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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