Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOFQ13790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOFQ13790 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOFQ13790 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOFQ13790 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOFQ13790 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOFQ13790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOFQ13790 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOFQ13790 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOFQ13790 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOFQ13790 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOFQ13790 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOFQ13790 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOFQ13790 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOFQ13790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOFQ13790 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOFQ13790 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOFQ13790 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOFQ13790 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOFQ13790 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOFQ13790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOFQ13790 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOFQ13790 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOFQ13790 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOFQ13790 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOFQ13790 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOFQ13790 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOFQ13790 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOFQ13790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOFQ13790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOFQ13790 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOFQ13790 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOFQ13790 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOFQ13790 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOFQ13790 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOFQ13790 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOFQ13790 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOFQ13790 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOFQ13790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOFQ13790 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOFQ13790 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOFQ13790 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOFQ13790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APOFQ13790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOFQ13790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOFQ13790 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOFQ13790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOFQ13790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOFQ13790 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOFQ13790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOFQ13790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOFQ13790 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOFQ13790 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOFQ13790 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOFQ13790 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOFQ13790 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOFQ13790 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOFQ13790 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOFQ13790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOFQ13790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOFQ13790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOFQ13790 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOFQ13790 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOFQ13790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOFQ13790 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOFQ13790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOFQ13790 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APOFQ13790 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOFQ13790 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOFQ13790 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOFQ13790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOFQ13790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOFQ13790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOFQ13790 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOFQ13790 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOFQ13790 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOFQ13790 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOFQ13790 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOFQ13790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
APOFQ13790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOFQ13790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOFQ13790 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOFQ13790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOFQ13790 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOFQ13790 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOFQ13790 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOFQ13790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOFQ13790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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