Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOFQ13790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOFQ13790 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOFQ13790 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOFQ13790 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOFQ13790 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOFQ13790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOFQ13790 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOFQ13790 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOFQ13790 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOFQ13790 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOFQ13790 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOFQ13790 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOFQ13790 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOFQ13790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOFQ13790 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOFQ13790 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOFQ13790 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOFQ13790 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOFQ13790 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOFQ13790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOFQ13790 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOFQ13790 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOFQ13790 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOFQ13790 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOFQ13790 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOFQ13790 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOFQ13790 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOFQ13790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOFQ13790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOFQ13790 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOFQ13790 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOFQ13790 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOFQ13790 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOFQ13790 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOFQ13790 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOFQ13790 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOFQ13790 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOFQ13790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOFQ13790 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOFQ13790 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOFQ13790 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOFQ13790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APOFQ13790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOFQ13790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOFQ13790 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOFQ13790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOFQ13790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOFQ13790 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOFQ13790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOFQ13790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOFQ13790 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOFQ13790 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOFQ13790 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOFQ13790 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOFQ13790 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOFQ13790 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOFQ13790 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOFQ13790 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOFQ13790 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOFQ13790 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOFQ13790 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOFQ13790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOFQ13790 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOFQ13790 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOFQ13790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOFQ13790 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOFQ13790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOFQ13790 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APOFQ13790 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOFQ13790 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOFQ13790 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOFQ13790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOFQ13790 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOFQ13790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOFQ13790 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOFQ13790 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOFQ13790 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOFQ13790 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOFQ13790 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOFQ13790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
APOFQ13790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOFQ13790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOFQ13790 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOFQ13790 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOFQ13790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOFQ13790 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOFQ13790 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOFQ13790 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOFQ13790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOFQ13790 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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