Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HTR4Q13639 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HTR4Q13639 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HTR4Q13639 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HTR4Q13639 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HTR4Q13639 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HTR4Q13639 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HTR4Q13639 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTR4Q13639 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HTR4Q13639 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HTR4Q13639 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HTR4Q13639 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HTR4Q13639 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTR4Q13639 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HTR4Q13639 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTR4Q13639 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTR4Q13639 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTR4Q13639 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HTR4Q13639 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HTR4Q13639 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HTR4Q13639 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HTR4Q13639 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HTR4Q13639 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HTR4Q13639 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
HTR4Q13639 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HTR4Q13639 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HTR4Q13639 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTR4Q13639 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTR4Q13639 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTR4Q13639 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HTR4Q13639 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HTR4Q13639 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HTR4Q13639 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HTR4Q13639 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HTR4Q13639 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HTR4Q13639 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HTR4Q13639 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HTR4Q13639 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HTR4Q13639 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HTR4Q13639 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTR4Q13639 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTR4Q13639 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HTR4Q13639 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HTR4Q13639 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HTR4Q13639 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HTR4Q13639 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTR4Q13639 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTR4Q13639 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTR4Q13639 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTR4Q13639 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTR4Q13639 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HTR4Q13639 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTR4Q13639 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTR4Q13639 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HTR4Q13639 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HTR4Q13639 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTR4Q13639 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTR4Q13639 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTR4Q13639 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTR4Q13639 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTR4Q13639 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTR4Q13639 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTR4Q13639 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HTR4Q13639 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTR4Q13639 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms