Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TCIRG1Q13488 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TCIRG1Q13488 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TCIRG1Q13488 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TCIRG1Q13488 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TCIRG1Q13488 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TCIRG1Q13488 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TCIRG1Q13488 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TCIRG1Q13488 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TCIRG1Q13488 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TCIRG1Q13488 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TCIRG1Q13488 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TCIRG1Q13488 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TCIRG1Q13488 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TCIRG1Q13488 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TCIRG1Q13488 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TCIRG1Q13488 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TCIRG1Q13488 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TCIRG1Q13488 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TCIRG1Q13488 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TCIRG1Q13488 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TCIRG1Q13488 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TCIRG1Q13488 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TCIRG1Q13488 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TCIRG1Q13488 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TCIRG1Q13488 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TCIRG1Q13488 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TCIRG1Q13488 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TCIRG1Q13488 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TCIRG1Q13488 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TCIRG1Q13488 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TCIRG1Q13488 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TCIRG1Q13488 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TCIRG1Q13488 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TCIRG1Q13488 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TCIRG1Q13488 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TCIRG1Q13488 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TCIRG1Q13488 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TCIRG1Q13488 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TCIRG1Q13488 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TCIRG1Q13488 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TCIRG1Q13488 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TCIRG1Q13488 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TCIRG1Q13488 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TCIRG1Q13488 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TCIRG1Q13488 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TCIRG1Q13488 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TCIRG1Q13488 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TCIRG1Q13488 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TCIRG1Q13488 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TCIRG1Q13488 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TCIRG1Q13488 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TCIRG1Q13488 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TCIRG1Q13488 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
TCIRG1Q13488 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TCIRG1Q13488 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TCIRG1Q13488 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TCIRG1Q13488 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TCIRG1Q13488 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TCIRG1Q13488 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TCIRG1Q13488 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TCIRG1Q13488 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TCIRG1Q13488 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TCIRG1Q13488 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TCIRG1Q13488 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TCIRG1Q13488 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TCIRG1Q13488 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
TCIRG1Q13488 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TCIRG1Q13488 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TCIRG1Q13488 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TCIRG1Q13488 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TCIRG1Q13488 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TCIRG1Q13488 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TCIRG1Q13488 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TCIRG1Q13488 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TCIRG1Q13488 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TCIRG1Q13488 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TCIRG1Q13488 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TCIRG1Q13488 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TCIRG1Q13488 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
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