Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SEMA3FQ13275 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SEMA3FQ13275 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SEMA3FQ13275 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SEMA3FQ13275 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SEMA3FQ13275 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SEMA3FQ13275 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SEMA3FQ13275 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SEMA3FQ13275 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SEMA3FQ13275 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SEMA3FQ13275 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SEMA3FQ13275 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SEMA3FQ13275 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEMA3FQ13275 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEMA3FQ13275 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEMA3FQ13275 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SEMA3FQ13275 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SEMA3FQ13275 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SEMA3FQ13275 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SEMA3FQ13275 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SEMA3FQ13275 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SEMA3FQ13275 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SEMA3FQ13275 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SEMA3FQ13275 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SEMA3FQ13275 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SEMA3FQ13275 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SEMA3FQ13275 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SEMA3FQ13275 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SEMA3FQ13275 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SEMA3FQ13275 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SEMA3FQ13275 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SEMA3FQ13275 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SEMA3FQ13275 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SEMA3FQ13275 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SEMA3FQ13275 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SEMA3FQ13275 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SEMA3FQ13275 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SEMA3FQ13275 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SEMA3FQ13275 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SEMA3FQ13275 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SEMA3FQ13275 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SEMA3FQ13275 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SEMA3FQ13275 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SEMA3FQ13275 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SEMA3FQ13275 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SEMA3FQ13275 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SEMA3FQ13275 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SEMA3FQ13275 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SEMA3FQ13275 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SEMA3FQ13275 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEMA3FQ13275 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SEMA3FQ13275 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SEMA3FQ13275 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SEMA3FQ13275 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SEMA3FQ13275 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SEMA3FQ13275 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SEMA3FQ13275 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SEMA3FQ13275 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SEMA3FQ13275 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SEMA3FQ13275 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SEMA3FQ13275 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SEMA3FQ13275 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SEMA3FQ13275 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SEMA3FQ13275 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SEMA3FQ13275 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SEMA3FQ13275 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SEMA3FQ13275 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SEMA3FQ13275 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SEMA3FQ13275 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SEMA3FQ13275 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SEMA3FQ13275 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEMA3FQ13275 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEMA3FQ13275 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEMA3FQ13275 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEMA3FQ13275 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEMA3FQ13275 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
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