Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPA4Q13156 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPA4Q13156 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPA4Q13156 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPA4Q13156 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPA4Q13156 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPA4Q13156 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPA4Q13156 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPA4Q13156 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPA4Q13156 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPA4Q13156 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPA4Q13156 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPA4Q13156 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPA4Q13156 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPA4Q13156 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPA4Q13156 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPA4Q13156 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPA4Q13156 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPA4Q13156 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPA4Q13156 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPA4Q13156 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPA4Q13156 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPA4Q13156 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPA4Q13156 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPA4Q13156 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPA4Q13156 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPA4Q13156 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RPA4Q13156 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPA4Q13156 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPA4Q13156 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPA4Q13156 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPA4Q13156 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPA4Q13156 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPA4Q13156 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPA4Q13156 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPA4Q13156 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPA4Q13156 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPA4Q13156 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPA4Q13156 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPA4Q13156 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPA4Q13156 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPA4Q13156 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPA4Q13156 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPA4Q13156 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPA4Q13156 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPA4Q13156 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPA4Q13156 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPA4Q13156 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPA4Q13156 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPA4Q13156 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPA4Q13156 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPA4Q13156 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA4Q13156 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA4Q13156 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA4Q13156 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA4Q13156 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA4Q13156 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA4Q13156 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA4Q13156 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA4Q13156 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPA4Q13156 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA4Q13156 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPA4Q13156 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA4Q13156 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA4Q13156 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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