Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NR1H3Q13133 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NR1H3Q13133 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NR1H3Q13133 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR1H3Q13133 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR1H3Q13133 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR1H3Q13133 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NR1H3Q13133 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NR1H3Q13133 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NR1H3Q13133 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NR1H3Q13133 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR1H3Q13133 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR1H3Q13133 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR1H3Q13133 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR1H3Q13133 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NR1H3Q13133 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NR1H3Q13133 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NR1H3Q13133 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NR1H3Q13133 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NR1H3Q13133 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NR1H3Q13133 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR1H3Q13133 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR1H3Q13133 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NR1H3Q13133 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NR1H3Q13133 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NR1H3Q13133 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NR1H3Q13133 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NR1H3Q13133 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR1H3Q13133 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR1H3Q13133 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NR1H3Q13133 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NR1H3Q13133 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NR1H3Q13133 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NR1H3Q13133 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NR1H3Q13133 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NR1H3Q13133 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR1H3Q13133 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NR1H3Q13133 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR1H3Q13133 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NR1H3Q13133 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR1H3Q13133 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NR1H3Q13133 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR1H3Q13133 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NR1H3Q13133 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NR1H3Q13133 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NR1H3Q13133 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1H3Q13133 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NR1H3Q13133 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR1H3Q13133 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR1H3Q13133 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR1H3Q13133 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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