Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BNIP3Q12983 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BNIP3Q12983 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BNIP3Q12983 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BNIP3Q12983 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BNIP3Q12983 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BNIP3Q12983 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BNIP3Q12983 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BNIP3Q12983 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BNIP3Q12983 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BNIP3Q12983 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BNIP3Q12983 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BNIP3Q12983 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BNIP3Q12983 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BNIP3Q12983 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BNIP3Q12983 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BNIP3Q12983 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BNIP3Q12983 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BNIP3Q12983 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BNIP3Q12983 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BNIP3Q12983 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BNIP3Q12983 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BNIP3Q12983 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BNIP3Q12983 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BNIP3Q12983 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BNIP3Q12983 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BNIP3Q12983 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BNIP3Q12983 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BNIP3Q12983 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BNIP3Q12983 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BNIP3Q12983 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BNIP3Q12983 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BNIP3Q12983 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BNIP3Q12983 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BNIP3Q12983 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BNIP3Q12983 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNIP3Q12983 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BNIP3Q12983 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BNIP3Q12983 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BNIP3Q12983 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BNIP3Q12983 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNIP3Q12983 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNIP3Q12983 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BNIP3Q12983 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BNIP3Q12983 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BNIP3Q12983 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BNIP3Q12983 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BNIP3Q12983 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BNIP3Q12983 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP3Q12983 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP3Q12983 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BNIP3Q12983 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BNIP3Q12983 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BNIP3Q12983 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BNIP3Q12983 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BNIP3Q12983 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BNIP3Q12983 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BNIP3Q12983 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BNIP3Q12983 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BNIP3Q12983 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BNIP3Q12983 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BNIP3Q12983 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BNIP3Q12983 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BNIP3Q12983 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BNIP3Q12983 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BNIP3Q12983 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms