Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF4Q08170 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF4Q08170 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRSF4Q08170 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF4Q08170 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF4Q08170 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF4Q08170 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRSF4Q08170 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF4Q08170 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF4Q08170 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF4Q08170 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF4Q08170 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF4Q08170 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF4Q08170 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF4Q08170 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF4Q08170 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF4Q08170 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF4Q08170 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF4Q08170 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF4Q08170 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF4Q08170 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF4Q08170 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF4Q08170 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRSF4Q08170 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF4Q08170 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRSF4Q08170 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF4Q08170 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF4Q08170 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF4Q08170 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF4Q08170 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF4Q08170 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF4Q08170 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRSF4Q08170 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF4Q08170 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF4Q08170 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms