Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNC4Q03721 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNC4Q03721 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNC4Q03721 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNC4Q03721 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNC4Q03721 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNC4Q03721 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNC4Q03721 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNC4Q03721 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNC4Q03721 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNC4Q03721 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNC4Q03721 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNC4Q03721 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNC4Q03721 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNC4Q03721 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNC4Q03721 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNC4Q03721 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNC4Q03721 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNC4Q03721 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNC4Q03721 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNC4Q03721 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNC4Q03721 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNC4Q03721 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNC4Q03721 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNC4Q03721 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNC4Q03721 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC4Q03721 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNC4Q03721 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNC4Q03721 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNC4Q03721 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNC4Q03721 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNC4Q03721 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNC4Q03721 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNC4Q03721 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNC4Q03721 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNC4Q03721 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNC4Q03721 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNC4Q03721 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNC4Q03721 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNC4Q03721 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNC4Q03721 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNC4Q03721 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms