Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIBQ01892 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIBQ01892 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIBQ01892 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIBQ01892 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPIBQ01892 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIBQ01892 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIBQ01892 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIBQ01892 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPIBQ01892 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPIBQ01892 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIBQ01892 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIBQ01892 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIBQ01892 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIBQ01892 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPIBQ01892 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIBQ01892 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPIBQ01892 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPIBQ01892 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIBQ01892 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIBQ01892 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIBQ01892 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPIBQ01892 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIBQ01892 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIBQ01892 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIBQ01892 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIBQ01892 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIBQ01892 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIBQ01892 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIBQ01892 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPIBQ01892 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPIBQ01892 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPIBQ01892 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIBQ01892 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIBQ01892 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIBQ01892 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIBQ01892 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIBQ01892 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPIBQ01892 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPIBQ01892 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIBQ01892 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIBQ01892 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIBQ01892 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIBQ01892 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIBQ01892 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms