Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP2R2BQ00005 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP2R2BQ00005 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP2R2BQ00005 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP2R2BQ00005 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP2R2BQ00005 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP2R2BQ00005 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP2R2BQ00005 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP2R2BQ00005 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP2R2BQ00005 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP2R2BQ00005 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP2R2BQ00005 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP2R2BQ00005 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPP2R2BQ00005 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP2R2BQ00005 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP2R2BQ00005 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP2R2BQ00005 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP2R2BQ00005 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP2R2BQ00005 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP2R2BQ00005 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP2R2BQ00005 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP2R2BQ00005 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP2R2BQ00005 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP2R2BQ00005 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP2R2BQ00005 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP2R2BQ00005 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP2R2BQ00005 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP2R2BQ00005 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP2R2BQ00005 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP2R2BQ00005 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP2R2BQ00005 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP2R2BQ00005 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP2R2BQ00005 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP2R2BQ00005 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP2R2BQ00005 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP2R2BQ00005 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPP2R2BQ00005 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPP2R2BQ00005 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP2R2BQ00005 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP2R2BQ00005 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP2R2BQ00005 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP2R2BQ00005 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP2R2BQ00005 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP2R2BQ00005 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP2R2BQ00005 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP2R2BQ00005 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP2R2BQ00005 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP2R2BQ00005 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms