Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CBX1P83916 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CBX1P83916 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CBX1P83916 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CBX1P83916 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CBX1P83916 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CBX1P83916 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CBX1P83916 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CBX1P83916 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CBX1P83916 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CBX1P83916 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CBX1P83916 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CBX1P83916 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CBX1P83916 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CBX1P83916 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CBX1P83916 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CBX1P83916 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CBX1P83916 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CBX1P83916 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CBX1P83916 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CBX1P83916 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CBX1P83916 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CBX1P83916 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CBX1P83916 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CBX1P83916 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CBX1P83916 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CBX1P83916 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CBX1P83916 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CBX1P83916 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CBX1P83916 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CBX1P83916 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CBX1P83916 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CBX1P83916 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CBX1P83916 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CBX1P83916 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CBX1P83916 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CBX1P83916 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CBX1P83916 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CBX1P83916 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CBX1P83916 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX1P83916 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX1P83916 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX1P83916 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX1P83916 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CBX1P83916 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CBX1P83916 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CBX1P83916 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CBX1P83916 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CBX1P83916 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CBX1P83916 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CBX1P83916 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CBX1P83916 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CBX1P83916 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CBX1P83916 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CBX1P83916 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CBX1P83916 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX1P83916 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX1P83916 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBX1P83916 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CBX1P83916 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CBX1P83916 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CBX1P83916 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CBX1P83916 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CBX1P83916 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX1P83916 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX1P83916 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CBX1P83916 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CBX1P83916 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CBX1P83916 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CBX1P83916 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CBX1P83916 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CBX1P83916 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CBX1P83916 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CBX1P83916 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CBX1P83916 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CBX1P83916 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CBX1P83916 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CBX1P83916 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CBX1P83916 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CBX1P83916 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX1P83916 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX1P83916 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX1P83916 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CBX1P83916 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CBX1P83916 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CBX1P83916 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CBX1P83916 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CBX1P83916 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CBX1P83916 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CBX1P83916 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CBX1P83916 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CBX1P83916 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CBX1P83916 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CBX1P83916 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CBX1P83916 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CBX1P83916 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CBX1P83916 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CBX1P83916 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CBX1P83916 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CBX1P83916 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms