Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSNK2BP67870 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSNK2BP67870 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSNK2BP67870 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSNK2BP67870 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSNK2BP67870 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK2BP67870 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSNK2BP67870 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSNK2BP67870 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSNK2BP67870 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSNK2BP67870 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSNK2BP67870 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK2BP67870 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSNK2BP67870 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSNK2BP67870 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSNK2BP67870 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK2BP67870 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK2BP67870 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK2BP67870 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSNK2BP67870 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSNK2BP67870 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSNK2BP67870 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSNK2BP67870 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSNK2BP67870 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSNK2BP67870 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSNK2BP67870 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSNK2BP67870 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSNK2BP67870 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK2BP67870 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSNK2BP67870 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSNK2BP67870 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSNK2BP67870 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSNK2BP67870 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSNK2BP67870 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSNK2BP67870 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSNK2BP67870 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSNK2BP67870 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSNK2BP67870 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK2BP67870 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSNK2BP67870 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK2BP67870 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSNK2BP67870 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms