Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNC1P63316 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNNC1P63316 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TNNC1P63316 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TNNC1P63316 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TNNC1P63316 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TNNC1P63316 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNNC1P63316 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TNNC1P63316 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TNNC1P63316 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TNNC1P63316 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TNNC1P63316 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNNC1P63316 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TNNC1P63316 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNNC1P63316 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TNNC1P63316 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TNNC1P63316 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNNC1P63316 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNNC1P63316 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNNC1P63316 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNNC1P63316 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNNC1P63316 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNNC1P63316 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNC1P63316 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNNC1P63316 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNNC1P63316 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNNC1P63316 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNNC1P63316 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNNC1P63316 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNNC1P63316 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TNNC1P63316 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNNC1P63316 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms