Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AP1S1P61966 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AP1S1P61966 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AP1S1P61966 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AP1S1P61966 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AP1S1P61966 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AP1S1P61966 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AP1S1P61966 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP1S1P61966 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AP1S1P61966 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP1S1P61966 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP1S1P61966 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP1S1P61966 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP1S1P61966 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AP1S1P61966 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AP1S1P61966 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AP1S1P61966 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP1S1P61966 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP1S1P61966 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP1S1P61966 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP1S1P61966 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP1S1P61966 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP1S1P61966 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AP1S1P61966 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP1S1P61966 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP1S1P61966 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AP1S1P61966 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP1S1P61966 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP1S1P61966 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP1S1P61966 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP1S1P61966 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP1S1P61966 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP1S1P61966 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP1S1P61966 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP1S1P61966 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP1S1P61966 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AP1S1P61966 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AP1S1P61966 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP1S1P61966 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP1S1P61966 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP1S1P61966 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP1S1P61966 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP1S1P61966 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP1S1P61966 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP1S1P61966 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP1S1P61966 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP1S1P61966 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP1S1P61966 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP1S1P61966 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP1S1P61966 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP1S1P61966 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP1S1P61966 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1S1P61966 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP1S1P61966 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP1S1P61966 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP1S1P61966 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP1S1P61966 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP1S1P61966 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP1S1P61966 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP1S1P61966 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP1S1P61966 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP1S1P61966 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1S1P61966 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1S1P61966 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1S1P61966 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1S1P61966 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms