Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB5BP61020 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB5BP61020 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB5BP61020 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB5BP61020 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB5BP61020 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB5BP61020 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB5BP61020 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB5BP61020 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB5BP61020 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB5BP61020 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB5BP61020 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB5BP61020 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB5BP61020 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB5BP61020 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB5BP61020 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB5BP61020 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB5BP61020 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB5BP61020 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB5BP61020 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB5BP61020 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB5BP61020 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB5BP61020 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB5BP61020 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB5BP61020 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB5BP61020 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB5BP61020 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms