Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXW4P57775 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXW4P57775 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXW4P57775 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXW4P57775 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXW4P57775 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXW4P57775 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXW4P57775 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXW4P57775 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXW4P57775 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXW4P57775 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW4P57775 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW4P57775 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW4P57775 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXW4P57775 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXW4P57775 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW4P57775 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXW4P57775 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW4P57775 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW4P57775 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW4P57775 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXW4P57775 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXW4P57775 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXW4P57775 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXW4P57775 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXW4P57775 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXW4P57775 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXW4P57775 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXW4P57775 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXW4P57775 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXW4P57775 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXW4P57775 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXW4P57775 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXW4P57775 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXW4P57775 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXW4P57775 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXW4P57775 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXW4P57775 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms