Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB25P57735 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB25P57735 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB25P57735 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB25P57735 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB25P57735 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB25P57735 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB25P57735 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB25P57735 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB25P57735 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB25P57735 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB25P57735 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB25P57735 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB25P57735 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB25P57735 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB25P57735 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB25P57735 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB25P57735 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB25P57735 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB25P57735 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB25P57735 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB25P57735 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB25P57735 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB25P57735 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB25P57735 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB25P57735 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB25P57735 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB25P57735 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB25P57735 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB25P57735 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB25P57735 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB25P57735 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB25P57735 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB25P57735 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB25P57735 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB25P57735 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB25P57735 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB25P57735 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB25P57735 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB25P57735 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB25P57735 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB25P57735 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB25P57735 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB25P57735 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB25P57735 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB25P57735 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB25P57735 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB25P57735 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB25P57735 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB25P57735 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB25P57735 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB25P57735 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB25P57735 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB25P57735 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB25P57735 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB25P57735 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB25P57735 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB25P57735 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB25P57735 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB25P57735 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB25P57735 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB25P57735 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB25P57735 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB25P57735 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB25P57735 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB25P57735 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB25P57735 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB25P57735 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB25P57735 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB25P57735 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB25P57735 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB25P57735 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB25P57735 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB25P57735 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB25P57735 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB25P57735 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB25P57735 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB25P57735 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB25P57735 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB25P57735 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB25P57735 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB25P57735 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB25P57735 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB25P57735 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB25P57735 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB25P57735 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB25P57735 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB25P57735 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB25P57735 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB25P57735 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB25P57735 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB25P57735 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB25P57735 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB25P57735 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB25P57735 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB25P57735 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB25P57735 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB25P57735 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB25P57735 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB25P57735 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms