Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2BFSP57053 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2BFSP57053 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2BFSP57053 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2BFSP57053 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2BFSP57053 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2BFSP57053 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2BFSP57053 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2BFSP57053 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2BFSP57053 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2BFSP57053 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2BFSP57053 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2BFSP57053 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2BFSP57053 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2BFSP57053 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2BFSP57053 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2BFSP57053 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2BFSP57053 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2BFSP57053 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2BFSP57053 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2BFSP57053 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2BFSP57053 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2BFSP57053 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2BFSP57053 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
H2BFSP57053 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2BFSP57053 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2BFSP57053 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2BFSP57053 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2BFSP57053 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2BFSP57053 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2BFSP57053 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2BFSP57053 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2BFSP57053 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2BFSP57053 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2BFSP57053 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2BFSP57053 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2BFSP57053 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2BFSP57053 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2BFSP57053 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H2BFSP57053 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2BFSP57053 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2BFSP57053 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2BFSP57053 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms