Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LGALS4P56470 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGALS4P56470 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGALS4P56470 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGALS4P56470 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGALS4P56470 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGALS4P56470 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGALS4P56470 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGALS4P56470 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGALS4P56470 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGALS4P56470 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGALS4P56470 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGALS4P56470 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGALS4P56470 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGALS4P56470 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGALS4P56470 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGALS4P56470 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGALS4P56470 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGALS4P56470 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGALS4P56470 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms