Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RABGGTBP53611 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RABGGTBP53611 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RABGGTBP53611 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RABGGTBP53611 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RABGGTBP53611 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RABGGTBP53611 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RABGGTBP53611 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RABGGTBP53611 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RABGGTBP53611 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RABGGTBP53611 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RABGGTBP53611 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RABGGTBP53611 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RABGGTBP53611 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RABGGTBP53611 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RABGGTBP53611 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RABGGTBP53611 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
RABGGTBP53611 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RABGGTBP53611 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RABGGTBP53611 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RABGGTBP53611 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RABGGTBP53611 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RABGGTBP53611 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RABGGTBP53611 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RABGGTBP53611 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RABGGTBP53611 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RABGGTBP53611 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RABGGTBP53611 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RABGGTBP53611 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RABGGTBP53611 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RABGGTBP53611 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RABGGTBP53611 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RABGGTBP53611 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RABGGTBP53611 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RABGGTBP53611 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RABGGTBP53611 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RABGGTBP53611 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RABGGTBP53611 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RABGGTBP53611 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RABGGTBP53611 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RABGGTBP53611 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RABGGTBP53611 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RABGGTBP53611 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RABGGTBP53611 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RABGGTBP53611 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RABGGTBP53611 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RABGGTBP53611 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RABGGTBP53611 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RABGGTBP53611 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RABGGTBP53611 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RABGGTBP53611 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RABGGTBP53611 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RABGGTBP53611 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RABGGTBP53611 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RABGGTBP53611 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RABGGTBP53611 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RABGGTBP53611 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RABGGTBP53611 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RABGGTBP53611 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RABGGTBP53611 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RABGGTBP53611 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RABGGTBP53611 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RABGGTBP53611 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RABGGTBP53611 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABGGTBP53611 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABGGTBP53611 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABGGTBP53611 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RABGGTBP53611 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABGGTBP53611 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
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