Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA4P52798 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA4P52798 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA4P52798 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA4P52798 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNA4P52798 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA4P52798 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA4P52798 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA4P52798 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFNA4P52798 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNA4P52798 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNA4P52798 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA4P52798 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA4P52798 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA4P52798 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFNA4P52798 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFNA4P52798 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFNA4P52798 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFNA4P52798 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFNA4P52798 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFNA4P52798 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFNA4P52798 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA4P52798 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFNA4P52798 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFNA4P52798 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNA4P52798 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA4P52798 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA4P52798 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA4P52798 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA4P52798 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA4P52798 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA4P52798 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA4P52798 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA4P52798 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA4P52798 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA4P52798 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFNA4P52798 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA4P52798 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFNA4P52798 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA4P52798 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA4P52798 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA4P52798 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA4P52798 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA4P52798 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFNA4P52798 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms