Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A1P52655 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A1P52655 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2A1P52655 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2A1P52655 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GTF2A1P52655 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2A1P52655 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GTF2A1P52655 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2A1P52655 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2A1P52655 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2A1P52655 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2A1P52655 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2A1P52655 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A1P52655 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A1P52655 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A1P52655 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A1P52655 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2A1P52655 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A1P52655 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2A1P52655 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2A1P52655 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2A1P52655 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2A1P52655 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2A1P52655 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2A1P52655 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A1P52655 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A1P52655 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A1P52655 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2A1P52655 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF2A1P52655 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2A1P52655 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A1P52655 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A1P52655 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A1P52655 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A1P52655 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A1P52655 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A1P52655 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2A1P52655 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.58■■■□□ 2
GTF2A1P52655 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2A1P52655 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2A1P52655 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A1P52655 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A1P52655 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A1P52655 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2A1P52655 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2A1P52655 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2A1P52655 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A1P52655 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2A1P52655 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A1P52655 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2A1P52655 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2A1P52655 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms