Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT1P50897 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPT1P50897 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT1P50897 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT1P50897 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT1P50897 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT1P50897 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT1P50897 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT1P50897 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT1P50897 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT1P50897 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT1P50897 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT1P50897 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT1P50897 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT1P50897 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT1P50897 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT1P50897 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT1P50897 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT1P50897 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT1P50897 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT1P50897 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT1P50897 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT1P50897 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT1P50897 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT1P50897 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT1P50897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT1P50897 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT1P50897 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT1P50897 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT1P50897 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPT1P50897 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPT1P50897 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPT1P50897 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPT1P50897 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPT1P50897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPT1P50897 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPT1P50897 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPT1P50897 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPT1P50897 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPT1P50897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPT1P50897 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPT1P50897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPT1P50897 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPT1P50897 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPT1P50897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPT1P50897 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPT1P50897 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPT1P50897 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPT1P50897 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPT1P50897 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPT1P50897 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPT1P50897 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPT1P50897 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPT1P50897 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPT1P50897 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPT1P50897 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPT1P50897 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPT1P50897 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPT1P50897 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPT1P50897 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPT1P50897 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPT1P50897 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPT1P50897 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPT1P50897 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPT1P50897 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPT1P50897 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPT1P50897 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPT1P50897 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPT1P50897 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPT1P50897 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPT1P50897 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPT1P50897 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPT1P50897 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPT1P50897 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPT1P50897 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPT1P50897 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPT1P50897 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPT1P50897 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPT1P50897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPT1P50897 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPT1P50897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPT1P50897 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPT1P50897 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPT1P50897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPT1P50897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPT1P50897 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPT1P50897 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms