Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLCSP50747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLCSP50747 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLCSP50747 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLCSP50747 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLCSP50747 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLCSP50747 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLCSP50747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLCSP50747 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLCSP50747 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLCSP50747 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLCSP50747 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLCSP50747 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLCSP50747 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLCSP50747 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLCSP50747 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLCSP50747 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLCSP50747 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HLCSP50747 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLCSP50747 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLCSP50747 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLCSP50747 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLCSP50747 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLCSP50747 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLCSP50747 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLCSP50747 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLCSP50747 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLCSP50747 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HLCSP50747 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HLCSP50747 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLCSP50747 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLCSP50747 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLCSP50747 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLCSP50747 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLCSP50747 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLCSP50747 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLCSP50747 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLCSP50747 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLCSP50747 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLCSP50747 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLCSP50747 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLCSP50747 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLCSP50747 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLCSP50747 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLCSP50747 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HLCSP50747 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLCSP50747 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLCSP50747 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLCSP50747 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLCSP50747 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLCSP50747 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HLCSP50747 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLCSP50747 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLCSP50747 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLCSP50747 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLCSP50747 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLCSP50747 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLCSP50747 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLCSP50747 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLCSP50747 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HLCSP50747 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLCSP50747 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLCSP50747 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLCSP50747 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLCSP50747 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLCSP50747 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLCSP50747 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLCSP50747 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLCSP50747 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLCSP50747 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLCSP50747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLCSP50747 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLCSP50747 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLCSP50747 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HLCSP50747 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLCSP50747 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLCSP50747 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLCSP50747 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLCSP50747 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLCSP50747 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLCSP50747 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLCSP50747 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLCSP50747 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HLCSP50747 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLCSP50747 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLCSP50747 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLCSP50747 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLCSP50747 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLCSP50747 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HLCSP50747 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLCSP50747 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLCSP50747 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLCSP50747 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLCSP50747 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLCSP50747 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLCSP50747 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLCSP50747 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLCSP50747 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLCSP50747 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLCSP50747 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms