Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD97P48960 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD97P48960 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD97P48960 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD97P48960 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD97P48960 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CD97P48960 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD97P48960 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD97P48960 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD97P48960 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD97P48960 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD97P48960 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD97P48960 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD97P48960 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD97P48960 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD97P48960 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD97P48960 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD97P48960 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD97P48960 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD97P48960 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD97P48960 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CD97P48960 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD97P48960 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD97P48960 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD97P48960 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD97P48960 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD97P48960 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD97P48960 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD97P48960 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD97P48960 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD97P48960 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD97P48960 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD97P48960 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD97P48960 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD97P48960 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD97P48960 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD97P48960 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD97P48960 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD97P48960 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD97P48960 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CD97P48960 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD97P48960 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD97P48960 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD97P48960 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD97P48960 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD97P48960 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD97P48960 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD97P48960 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD97P48960 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD97P48960 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD97P48960 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD97P48960 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD97P48960 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD97P48960 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD97P48960 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD97P48960 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CD97P48960 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CD97P48960 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD97P48960 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD97P48960 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CD97P48960 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD97P48960 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CD97P48960 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD97P48960 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD97P48960 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD97P48960 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD97P48960 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD97P48960 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD97P48960 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD97P48960 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD97P48960 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD97P48960 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CD97P48960 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD97P48960 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CD97P48960 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CD97P48960 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CD97P48960 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CD97P48960 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CD97P48960 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD97P48960 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CD97P48960 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD97P48960 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CD97P48960 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD97P48960 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD97P48960 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD97P48960 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD97P48960 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD97P48960 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD97P48960 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD97P48960 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD97P48960 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD97P48960 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD97P48960 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CD97P48960 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD97P48960 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CD97P48960 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD97P48960 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD97P48960 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD97P48960 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CD97P48960 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms