Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSN1S1P47710 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSN1S1P47710 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSN1S1P47710 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSN1S1P47710 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSN1S1P47710 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSN1S1P47710 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSN1S1P47710 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSN1S1P47710 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSN1S1P47710 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSN1S1P47710 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSN1S1P47710 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSN1S1P47710 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSN1S1P47710 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSN1S1P47710 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSN1S1P47710 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSN1S1P47710 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSN1S1P47710 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSN1S1P47710 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSN1S1P47710 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSN1S1P47710 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSN1S1P47710 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSN1S1P47710 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSN1S1P47710 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSN1S1P47710 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSN1S1P47710 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSN1S1P47710 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSN1S1P47710 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms